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Está formado por varias islas e islotes, entre los que destacan, la isla de Cabrera, Isla Conejera, Isla Redonda, isla Pobre e islote de naforada.
Se conocen al menos 450 especies vegetales. La vegetación dominante es la maquia mediterránea muy variable en composicion y fisonomía según la exposición de las islas a la solana y a los temporales. Cabrera esta tapizada por un joven pinar de pino carrasco.
Se han descrito asimismo 30 endemismos, cinco de los cuales forman en Cabrera variedades propias. Entre ellos destaca en Ilampúdol bord. Se han descrito nada menos que 10 razas diferentes de lagartija de las Baleares viviendo en los diferentes islotes, ademas de salamanquesa común y rosada y tortuga mediterránea.
La fauna terrestre es discreta, sin embargo, la avifauna marina esta representada por todas las especies que se reproducen en las riberas mediterráneas, al menos 150, 25 de ellas nidificantes.
Son importantes las colonias de pardela cenicienta. gaviota patiamarilla y cormorán moñudo. Tambien hay, aunque en número mas escaso paíño y pardela pichoneta balear (endémica del archipiélago) y se reproducen dos parejas nidificantes de águila pescadora aunque en el pasado Ilegó a haber cuatro.
Es Importante la colonia de halcón de Eleonor durante los meses de verano y todos los islotes resultan un lugar de paso importantísimo para las especies migratorias. En los acantilados tienen su territorio de cría el halcón peregrino y hay varias parejas de Cernícalo común. Hay que destacar tambien a la curruca sarda. una especie mediterránea que. en España, se reproduce fundamentalmente en las islas Baleares, donde forma una subespecie endémica.
La parte marina del Parque es igualmente rica desde praderas de Posidonia Oceánica en las que se fijan mas de 60 especies diferentes de algas, a fondos coralígenos en los que los especialistas han creído encontrar rasgos de la naturaleza tropical.
En las aguas de Cabrera es frecuente la presencia de delfines y, ocasionalmente, rorcuales y cachalotes aunque estos últimos no se acercan hasta tierra firme. En el medio marino habitan 214 especies de peces ademas de la tortuga mora, la tortuga verde y la tortuga laúd, esta ultima en grave peligro de extinción.
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